Şirkət 1993-cü ildə dəniz nəqliyyatı və ixtisaslaşdırılmış gəmilərin naviqasiya və təcili təmir xidmətlərini həyata keçirən xidmət müəssisəsi olaraq təsis edilmişdir. Müəssisə o zaman özəl gəmi təmiri sahələrində və dövlət gəmi təmiri müəssisələrinin rəhbərləri arasında tanınan gənc, enerjili, sertifikatlı mütəxəssislər tərəfindən qurulmuşdur.
Şirkət aparıcı Ali Dəniz təhsil müəssisələrinin diplomlarına sahib olan dəniz mühəndislərinin bilik və praktik təcrübəsinə əsaslanır. Mütəxəssislərin əksəriyyəti Odessa Dəniz Donanmasının Mühəndisləri İnstitutunu (indiki – Odessa Milli Dəniz Universiteti) və Leninqrad (indiki Sankt-Peterburq) Gəmiqayırma İnstitutunu bitirib.
Şirkətin inzibati və istehsal strukturu Rusiya və Azərbaycanın gəmiqayırma zavodlarında və tərsanələrində toplanmış təcrübəyə malikdir. Bir neçə il ərzində şirkət “SAQA” firması adı altında fəaliyyət göstərmişdir. Bu illər ərzində şirkət əhəmiyyətli istehsal və idarəetmə təcrübəsi toplamışdır.
1997-ci ilin sonunda istehsalın yeni, daha yüksək səviyyədə təşkil olunmasına keçidlə, habelə müəssisə daxilində resursların yenidən bölüşdürülməsi ilə əlaqədar təsisçilər qrupu tərəfindən müəssisənin yenidən qeydiyyata alınması və adının dəyişdirilməsi haqqında qərar qəbul edildi.
1998-ci ilin əvvəlindən müəssisə “SAQA Gəmi Təmiri” şirkəti adını daşımağa və uğurlu inkişafını davam etdirməyə başladı. Şirkət tərəfindən çox sayda dəniz nəqliyyatı və xüsusi gəmilər, eləcə də üzən konstruksiyalar təmir edilmişdir.
Şirkət digər gəmiqayırma təşkilatları ilə birlikdə əsas İcraçı və subpodratçı kimi müxtəlif layihələrdə iştirak etmişdir. Öz baza ehtiyatlarından səmərəli istifadə edib genişləndirməklə Şirkət gəmi inşaatı və gəmi təmirindən fərqlənən dəniz sənaye texnologiyalarının yeni istiqamətlərini mənimsəmişdir. Bu gün Şirkət həm dənizdə, həm də quruda həyata keçirilən dəniz mühəndisliyi layihələri ilə müşayiət olunan işlərin siyahısına əsas mahiyyəti mühəndis-texnoloji, istehsalat xidmətləri və fəaliyyətləri olan müxtəlif kompleks layihələr həyata keçirir.
Şirkət tərəfindən istifadə olunan əməkdaşlıq üsulları tərəfdaşlar üçün çox faydalı və əlverişlidir. Şirkət əsasən öz istehsalat sahələrində fəaliyyət göstərir, zərurət yarandıqda istehsalatda dövlət gəmiqayırma zavodlarının və tərsanələrinin istehsal sahələrindən istifadə edir. Şirkətin məqsədi dəniz texnikasının ayrı-ayrı hissələrinin istehsalını təmin edə biləcək yeni gəmi təmiri və gəmiqayırma müəssisəsi qurmaq və təchiz etməkdir.
2002-ci ildən etibarən “SAQA Gəmi Təmiri” şirkəti Qazaxıstan tərəfdaşı “SakEl” MMC ilə birlikdə Aktauda (Qazaxıstan Respublikası) müştərək “SAGA Ataş” Məhdud Məsuliyyətli Cəmiyyətini qurdu. Qısa müddət ərzində “SAGA Ataş” MMC gəmilərin dayaq qurğuları və yanalma vasitələri, üzən qaldırıcı barjalar, yedəklər və s. daxil olduğu öz təmir bazasını yaratdı.
Bu gün “SAGA Ataş” MMC, Xəzər dənizinin Qazaxıstan sektorunda gəmi təmiri işində lider mövqe tutur və uğurla inkişaf edir.
2018-ci ildən “SAQA Gəmi Təmiri” şirkətinin bazasında yaradılmış “SAQA GƏMİ TƏMİRİ” MMC adı ilə fəaliyyət göstərir.